Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtpreP49446 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PtpreP49446 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtpreP49446 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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PtpreP49446 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms