Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkx1-2P42580 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkx1-2P42580 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms