Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cd28P31041 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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