Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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