Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjc1P28229 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjc1P28229 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms