Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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