Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChkbO55229 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChkbO55229 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms