Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna5O08543 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms