Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c2J3QNM1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c2J3QNM1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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