Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47eD3YWC7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47eD3YWC7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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