Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ssxb8B1AY40 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssxb8B1AY40 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ssxb8B1AY40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb8B1AY40 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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