Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF22A3QJZ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms