Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trav14-2A0A075B694 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trav14-2A0A075B694 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Trav14-2A0A075B694 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trav14-2A0A075B694 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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