Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx1Q9WV80 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms