Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited4Q9WUL8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited4Q9WUL8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms