Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHRF1Q9P1Y6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHRF1Q9P1Y6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms