Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfmbt1Q9JMD1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms