Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms