Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubgcp4Q9D4F8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubgcp4Q9D4F8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms