Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MINDY3Q9CV28 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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