Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim8Q9CQQ0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms