Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt84Q99M73 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt84Q99M73 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt84Q99M73 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt84Q99M73 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms