Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nmd3Q99L48 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nmd3Q99L48 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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