Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms