Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp45Q8K387 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp45Q8K387 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms