Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933409G03RikQ8C5U0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms