Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Avl9Q80U56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Avl9Q80U56 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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