Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lcn3Q62471 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lcn3Q62471 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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