Protein–RNA interactions for Protein: Q562E2

Kctd19, BTB/POZ domain-containing protein KCTD19, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd19Q562E2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd19Q562E2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd19Q562E2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms