Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slfn4Q3UV66 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slfn4Q3UV66 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms