Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Skap2Q3UND0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms