Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Parp3Q3ULW8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms