Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip13Q3UA06 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms