Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc9Q3U0M1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms