Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZFHX3Q15911 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms