Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MitfQ08874 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms