Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms