Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp11Q02853 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms