Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zfp39Q02525 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp39Q02525 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms