Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms