Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd1Q01822 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms