Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh6P97326 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh6P97326 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms