Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SeboxP70368 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SeboxP70368 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SeboxP70368 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SeboxP70368 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SeboxP70368 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeboxP70368 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SeboxP70368 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms