Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crip1P63254 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms