Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps28P62858 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms