Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm6P62313 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm6P62313 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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