Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms