Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrbP28704 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrbP28704 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxrbP28704 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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