Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ntf3P20181 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms