Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P18528 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P18528 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
P18528 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
P18528 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms